نوقشت اطروحة دكتوراه في كلية التربية للعلوم الصرفة – قسم علوم الحياة أطروحة دكتوراه في قسم علوم الحياة تناقش ( عزل وتشخيص بعض من انواع بكتريا Mycoplasma من مصادر اخماج مختلفة والكشف جزيئيا عن الجينات المسؤولة لبعض عوامل ضرواتها) للطالب محمد علي حسين برئاسة الاستاذ الدكتور علي صالح حسين رئيس الجامعة العراقية
أجريت هذه الدراسة في مختبرات جامعة الانبار لعزل وتشخيص بعض انواع بكتريا المايكوبلازما ، تضمنتالدراسةجمع 200 عينة منالسائلالمنويمنرجالمصابين بالعقم تم التشخيص من خلال الزرع المباشر والخصائص الكيموحيوية كما اعتمد التشخيص النهائي باستخدام اختبار تفاعل البلمرة المتسلسل PCR لعدة جينات منها 16srRNA وبعض جينات الضراوة (vaa , recA urease, upV) ، اشارت النتائج إلى ان 82 عزلة اعطت نمواً موجباً وبنسبة 41% منها 68 عزلة تعود لبكتريا Ureaplasma parvum وبنسبة 34%، في حين كانت بقية العزلات تعود لبكتريا Mycoplasma hominis بواقع 14 عزلة وكانت نسبتها 7%، كانت اعلى نسبة اصابة لبكتريا U.parvum عند الفئة العمرية 35-39 بنسبة ظهور15% كما سجلت بكتريا الـ M.hominis اعلى نسبة اصابة عند الفئة العمرية 40-44 بنسبة 3.5% ، وكانت اقل نسبة اصابة لبكتريا Ureaplasma بنسبة 0.5% وبكتريا M.hominis بنسبة 0 % عند الفئة العمرية 50-54، تم اجراء التحليل الوراثي للعزلات وتسجيلها في بنك الجينات العالمي ومطابقة التسلسلات الجينية مع التسلسلات العالمية المسجلة وتم تسجيل التغيرات الجينية من خلال عمل مطابقة للتسلسلات المدروسة (النيوكليوتيدات والاحماض الامينية) مع التسلسلات العالمية كما تم تحديد المواقع الجينية ضمن التسلسلات البكتيرية وتم انشاء شجرة وراثية لبيان موقع العزلات المدروسة من العزلات العالمية ، تم الكشف عن الجين 16srRNA لبكتريا الـ M.hominis وتم عمل تحليل التسلسل الجيني لأربع عزلات في هذه الدراسة وتبين أن الاختلاف في الجين 16srRNA يمكن استخدامه في الكشف عن الطرز الوراثية للــM.hominis ، سجلت التسلسلات في بنك الجينات بالأرقام التسلسلية من OM327748إلى OM327751وكانت نسبة التطابق 100% ، كشفت نتائج التطابق عن عدم وجود اختلافات في الحمض النووي في تسلسل هذا الجين ، من ملاحظة الشجرة الوراثية ظهرت العزلات المدروسة في المنطقة المجاورة مباشرة للسلالة الفرنسية (Strain 4235 ) والمسجلة بالرقم (CP038014.1)، كما تم الكشف عن جين recAالعائد لنفس البكتريا وتم عمل تحليل التسلسل الجيني لعزلة واحدة سجلت في بنك الجينات بالرقم التسلسلي (ON037199 ) كما أظهرت المطابقة مع العزلات العالمية ما يصل إلى 100 % من التشابه ، كشفت نتائج المطابقة للجين recAعن وجود اختلاف واحد في الحمض النووي للعزلة المدروس عند الموقع 329 اذ تم استبدال القاعدة النيتروجينية Guanine إلى القاعدة النيتروجينية Adenine وأن المتغير المدروس أظهر تأثيرًا صامتًا ، بّينت الشجرة الوراثية ان تسلسل الجين recA كان بجانب السلالة الالمانية Strain 2539 المسجلة بالرقم (CP026341.1)، اما فيما يتعلق بالجين Vaa تم تضمين عزلة واحدة لدراسة التحليل الوراثي ، سجلت في بنك الجينات بالرقم التسلسلي (ON037200) ، أظهرت المطابقة ما يصل إلى 100 % من التشابه ، كما كشفت نتائج المطابقة للجين عدم وجود أي اختلاف في التسلسل الجيني مقارنة بالتسلسلات العالمية اظهرت الشجرة الوراثية ان تسلسل جين Vaa كان بجانب السلالة الفرنسية المسجلة بالرقم (GenBank acc. no. CP035543.1)،اظهرت نتائج الكشف عن جين Urease في بكتريا Ureaplasmaان السلالة Ureaplasma parvum serovar 3 هي المسببة للاصابة في العزلات المدروسة، تم عمل تحليل التسلسل الجيني لعشرين عزلة،سجلت في بنك الجينات بالأرقام التسلسلية من OM362258إلىOM362277 ،بعد مطابقة التسلسلات وجد ان التشابه يصل إلى 99.5 % بين العزلات المدروسة والعزلات المرجعية لهذا الجين وأظهرت نتائج المطابقة وجود ثلاثة متغايرات للحمض النووي في العزلةS16 (طفرة استبدال الادنين محل الثايمين في الموقع 288 واستبدال الادنين محل الكوانين في الموقع 289 واستبدال الكوانين محل الادنين في الموقع 305 )واثنين من متغيرات الحمض النووي في عزلة S19 (طفرة استبدال الثايمين محل السايتوسين في الموقع 204 والموقع 218)،أدت طفرة الاستبدال في العزلة S19 إلى تغيير في الحمض الأميني الناتج عن عملية الترجمة عن طريق تغيير الأحماض الأمينية من Valineإلى Isoleucine و Serineإلى Asparagine على التوالي ، بينما لم تظهر طفرة الاستبدال في العزلة S16 أي تغيير في الأحماض الأمينية ، كما اشارت الشجرة الوراثية ان التسلسلات المدروسة ظهرت بجانب السلالة الصينية المسجلة بالرقم (AF222894.1)GenBank acc، كما تم تضخيم جين upV لنفس البكتريا وتم عمل تحليل التسلسل الجيني لعزلة واحدة سجلت في بنك الجينات بالرقم (ON037201) وكانت نسبة التطابق 100% ، كشفت نتائج المحاذاة عن عدم وجود اختلافات في الحمض النووي في تسلسل هذا الجين ، لم يُظهر الجينupV ابتعادا ًعن التسلسلات الموجودة بسبب عدم وجود أي تباين يمكن اكتشافه في هذا التسلسل، بينت الشجرة الوراثية ان تسلسل الجين upV ظهر في المنطقة المجاورة مباشرة للسلالة الصينية المسجلة بالرقم(CP041199.1) .
